Journal des maladies tropicales et de la santé publique

Abstrait

Performance du test GeneXpert dans la détection de la tuberculose pulmonaire et de la résistance à la rifampicine chez les patients hospitalisés à l'hôpital du comté de Kitui, au Kenya

Muia PK, Ngugi MP et Mburu DN

Contexte : Pour lutter contre les défis posés par l'épidémie de tuberculose au Kenya, les installations de traitement et de diagnostic ont été massivement renforcées. Les défis rencontrés dans ces centres sont l'incapacité à détecter avec précision Mycobacterium tuberculosis . Dans ce travail, nous avons cherché à évaluer les performances du test GeneXpert MTB/RIF dans la détection de la tuberculose pulmonaire et les tests de résistance aux médicaments.

Méthodes : La microscopie des frottis, le test à la niacine, la culture et le test GeneXpert MTB/RIF ont été utilisés pour tester la présence de Mycobacterium tuberculosis dans les échantillons d'expectorations de 400 patients. Les tests de sensibilité aux médicaments ont été réalisés à l'aide de la méthode de culture et du test GeneXpert MTB/RIF.

Résultats : Sur les 400 échantillons analysés, 37,5 % étaient positifs au frottis, dont 60 % (p<0,05) étaient des hommes. Pour les tests de culture et GeneXpert, les échantillons positifs étaient respectivement de 33 % et 32,25 %. La microscopie des frottis présentait le plus grand nombre de faux positifs (28 %) et de faux négatifs (9,6 %). Pour l'identification des bacilles, la sensibilité, la spécificité, la valeur prédictive positive et les valeurs prédictives négatives pour la microscopie des frottis étaient de 81,8 %, 84,3 %, 72 % et 90,4 %, tandis que pour GeneXpert, elles étaient respectivement de 97,7 %, 100 %, 100 % et 98,9 %. Cela implique que GeneXpert était une meilleure méthode.

Les tests de sensibilité aux médicaments par la méthode de culture ont montré que 23 isolats étaient résistants à la rifampicine et avec GeneXpert, ils étaient 26, ce qui implique 3 faux positifs. La sensibilité, la spécificité, la valeur prédictive positive et la valeur prédictive négative du test GeneXpert dans les tests de sensibilité aux médicaments étaient de 100 %, 97 %, 89 % et 100 %. Le coût des tests d'échantillons avec le test GeneXpert était plus élevé que celui de la culture, mais il offre une détection rapide dans la mesure où il fallait en moyenne entre 2 heures et 8 semaines pour la méthode de culture.

Conclusion : Le test GeneXpert MTB/RIF offre un potentiel élevé pour le diagnostic rapide de la tuberculose et les tests de sensibilité aux médicaments dans un environnement kenyan austère.