Journal de bioéquivalence et de biodisponibilité

Abstrait

Optimisation des leads basés sur les pharmacochophores et analyse d'amarrage moléculaire pour la détection d'un puissant inhibiteur contre la protéine HCRTR2

Maryam Maqbool*

L'insomnie est un problème de santé publique croissant, car sa prévalence augmente de jour en jour. C'est l'un des troubles du sommeil les plus courants chez les Asiatiques. 1 personne sur 10 souffrant d'insomnie souffre d'insomnie. Parmi tous les troubles du sommeil, environ 6 à 10 % répondent aux critères de l'insomnie. Elle est très fréquente chez les femmes par rapport aux hommes. Dans ce travail de recherche, nous nous concentrons sur l'identification d'un médicament potentiel à base de cible afin de fournir un traitement efficace à partir de plantes médicinales. Dans cette étude de recherche, une approche pharmacophore basée sur le ligand a été utilisée, suivie d'un amarrage moléculaire et d'un criblage virtuel. Le serveur Protox a été utilisé pour la prédiction de la classe de toxicité. Les propriétés moléculaires des constituants chimiques possédant des propriétés anti-insomnie ont été vérifiées via Swiss ADME, l'outil de prédiction des propriétés ADMET et l'outil d'exploration des propriétés Osiris. Le pharmacophore à base de ligand de quatre composés d'Osmium basilicum a été réalisé puis criblé par rapport aux bibliothèques Zinc, Princeton et Drug Bank à l'aide de Ligand Scout, puis du composé avec un score d'ajustement pharmacophore plus élevé avec les CID NS_013367, NS_005529, NS_007342, NS_011378 et NS_011361. NS_011285 ont été sélectionnés pour l'amarrage. Français L'amarrage moléculaire a été effectué de la protéine cible HCRTR2 souhaitée avec les composés sélectionnés un par un à l'aide d'Autodockvena, puis la meilleure pose qui montre le meilleur angle d'orientation de l'emplacement a été sélectionnée pour une étude plus approfondie qui présente une énergie de liaison minimale et les résultats de l'amarrage ont été analysés via Pymol et Discovery Studio. Le composé avec le numéro CID NS_011285 possède la meilleure pose et une énergie de liaison plus ou moins importante -9,4 par rapport aux autres composés. La structure 2D montre l'interaction de l'acide aminé MET, VAL, LEU, PHE et ARG 2D avec la protéine mutée HCRTR2 et le type d'interactions telles que Alkyl, Pi-Alkyl, Pi-Sigma et Pi-Sulphur. Enfin, nous avons identifié le ligand qui possède les meilleures propriétés de similitude avec les médicaments et le potentiel d'inhiber l'activité HCRTR2 qui est le principal responsable du trouble de l'insomnie.