Technologie génétique

Abstrait

Caractérisation phénotypique et génotypique de Carnobacterium divergens isolé à partir de viande de bœuf crue hachée tunisienne réfrigérée

Thouraya Mokrani, Inès Essid, Mnasser Hassouna, Lachheb Jihene, Ghram Abdeljalil et Ahlem Jouini

Six souches psychotropes de Carnobacterium divergens ont été isolées à partir de viande hachée crue tunisienne conditionnée et stockée à 6°C. Elles ont d'abord été identifiées par des méthodes biochimiques. Elles ont été ensuite caractérisées par des techniques moléculaires. La souche de Carnobacterium divergens est un bâtonnet psychotrope Gram positif, immobile, dépourvu de catalase, d'oxydase et de mannitol. Elle pousse à pH 9,1 (gélose D-MRS), mais pas sur gélose acétate (pH ≤ 5,4). Pour tous ces isolats, l'identification phénotypique, à l'aide du système API 50 CHL, a révélé une variabilité des capacités fermentaires de certains sucres (glycérol, amygdaline, arbutine, D-tréhalose et gluconate de potassium). Des amorces de réaction en chaîne par polymérase (PCR) spécifiques à l'espèce ont été utilisées pour assurer l'identification de ces souches isolées au niveau de l'espèce. De plus, le séquençage du gène 16S rRNA a confirmé que les six isolats sont identifiés comme C. divergens. La technique Rep-PCR a été réalisée pour étudier la diversité intraspécifique au sein de ces six souches de C. divergens, communément identifiées dans la viande. La méthode Rep-PCR a permis de distinguer les souches de C. divergens, démontrant leur biodiversité et leurs similitudes évidentes. Les amorces BOX et REP ont permis une amplification avec 85 % et 80 % de similitudes entre les souches, respectivement. Les amorces BOXA1R et REP se sont avérées utiles pour la différenciation des souches de C. divergens.