Journal of Aquaculture Research & Development

Abstrait

Caractérisation phénotypique et génotypique de certaines espèces de Pseudomonas associées à Burkholderia cepacia isolées à partir de divers poissons infectés

Manal I El-Barbary et Ahmed M Hal

Cette étude vise à caractériser les espèces de Pseudomonas qui ont été isolées à partir de divers poissons d'eau douce et d'eau de mer naturellement malades, de tilapias du Nil, de poissons-chats, de dorades royales et de bars, en utilisant la méthode phénotypique, les caractères morphologiques et biochimiques à l'aide de l'API 20NE et la méthode génotypique (séquençage du gène 16S rRNA) avec certaines des caractéristiques histopathologiques. Six des sept espèces présumées de Pseudomonas ont été identifiées avec succès par la méthode API 20NE pour niveler les espèces ; elles ont été identifiées comme 2 P. fluorescens, une P. putida, une Pseudomonas sp. et 3 Burkholderia cepacia tandis que génotypiquement avec le séquençage du gène 16S rRNA qui s'est avéré réussi pour les quatre isolats de pseudomonas (trois comme P. fluorescens et un P. putida). Les résultats de l'analyse phylogénétique ont placé les isolats dans le genre Pseudomonas sur la base d'une homologie de 99 %. Le test de provocation a révélé que P. fluorescens et P. putida doivent être classés comme pathogènes pour O. niloticus et qu'ils présentaient également des signes cliniques et des taux de mortalité allant jusqu'à 70 % et montraient des modifications histopathologiques du foie et des reins qui ont conduit à la mort. L'étude d'antibiogramme n'a montré aucune différence significative entre P. fluorescens et P. putida qui avaient une sensibilité intrinsèquement élevée aux inhibiteurs de la synthèse des acides nucléiques tels que la ciprofloxacine, la norfloxacine, la gentamycine, la gatifloxacine, la loméfloxacine et la kanamycine. Cette étude a conclu qu'une bonne concordance globale entre les procédures d'identification phénotypique et génotypique a été trouvée pour les isolats avec quelques différences mineures dans les caractéristiques biochimiques et physiologiques observées entre les souches de P. fluorescens, tandis que les différences génotypiques ont été observées de manière significative entre P. fluorescens et P. putida isolés de divers poissons.