Abstrait

Analyse phylogénétique des séquences aiguës et chroniques et modèles mathématiques de la diversification précoce du VHC

Rébecca Clain

Près de 170 millions de personnes, soit environ 3 % de la population mondiale, sont infectées par le virus de l'hépatite C (VHC). Le virus provoque une large gamme d'effets pathologiques, dont les plus notables sont les maladies chroniques du foie, la cirrhose et le carcinome hépatocellulaire presque toujours mortel. La raison la plus courante de transplantation hépatique aux États-Unis est l'infection par le VHC. Le VHC est un virus à ARN avec un brin positif, une enveloppe non segmentée et une longueur d'environ 9,6 kb. Le virus appartient à la famille plus large des Flavivirus, qui contient également les virus du Nil occidental, de la fièvre jaune et de la dengue, entre autres. Il est classé dans le genre Hepacivirus. Les Flaviviridae partagent la capacité de se répliquer uniquement lorsqu'une ARN polymérase dépendante de l'ARN (RdRp) exprimée par le virus est présente. La RdRp est sujette aux erreurs et le VHC est connu pour avoir une large gamme de variations au sein d'un même individu et entre les individus. Les séquences nucléotidiques des sept principaux génotypes du VHC variaient d’environ 30 % à l’échelle mondiale.

 

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