Journal de pathologie végétale et de microbiologie

Abstrait

Analyse phylogénétique des espèces d'Alternaria associées à la pourriture noire des agrumes en Iran

Shideh Mojerlou et Naser Safaie

La pourriture noire des agrumes causée par Alternaria spp. est un problème post-récolte important en Iran. L'agent causal de la pourriture noire a été initialement identifié comme A. citri par Ellis et Pierce. Le genre Alternaria circonscrit une diversité morphologique considérable et la pourriture noire des agrumes peut être causée par plus d'une espèce morphologique en plus d'A. citri. L'identification morphologique des Alternaria spp. à petites spores est difficile. Une analyse phylogénétique a été réalisée sur 7 isolats d'Alternaria à petites spores provenant d'agrumes atteints de pourriture noire en Iran en utilisant des données de séquence d'un locus anonyme, OPA10-2. Des échantillons ont été collectés sur des oranges Navel dans la province de Mazandaran dans le nord de l'Iran. Tous les isolats ont provoqué la pourriture noire dans un essai d'inoculation de fruits avec des oranges Navel et Valencia et des différences significatives ont été observées entre
les cultivars et entre les isolats. Aucune association n'a été trouvée entre la classification morphologique et le clade phylogénétique. Nous avons identifié A. tenuissima (ALT 6) comme les agents causaux de la pourriture noire des agrumes. Deux isolats (ALT8 et ALT9) ont été regroupés séparément des autres clades dans la plupart des arbres parcimonieux. Cela suggère que les deux appartiennent à des espèces différentes. Il s'agit du premier rapport de caractérisation moléculaire des espèces d'Alternaria associées aux agrumes en Iran et A. tenuissima est signalé comme l'agent causal de la pourriture noire des agrumes en Iran pour la première fois.