Journal de bactériologie et parasitologie

Abstrait

Groupement phylogénétique des isolats fécaux dominants d'Escherichia coli provenant d'hommes et de femmes en bonne santé dans la province d'Al-Kut/Wasit/Irak

Sareaa MG Al-Mayahie, Alaa AM Al-Khafajy, Nuha AS Dosh, Assel RK Al-Rekabi et Ahlam GN Al-Atabie

Les isolats fécaux d' Escherichia coli sont divisés en quatre groupes phylogénétiques principaux appelés A, B1, B2 et D. La plupart des souches commensales appartiennent au groupe A et ont moins de facteurs de virulence que les souches d'E. coli pathogènes extra-intestinaux (ExPEC). Cette étude a été principalement conçue pour le regroupement phylogénétique d'isolats fécaux commensaux d'E. coli provenant d'hommes et de femmes en bonne santé dans la ville d'Al-Kut/province de Wasit/Irak à l'aide de protocoles basés sur la PCR. Les gènes de virulence d'ExPEC ont également été détectés parmi ces isolats. Français Parmi les isolats inclus dans cette étude (n = 205), le groupe A était le plus courant parmi les isolats des femmes et des hommes (68,5 % contre 63,0 %, respectivement), suivi des groupes : B1 (15,7 % contre 22,6 %, respectivement), D (10,7 % contre 9,5 %, respectivement) et B2 (4,1 % contre 4,7 %, respectivement). La distribution des sexes des groupes phylogénétiques a montré des différences insignifiantes entre les femmes et les hommes. Les isolats des femmes et des hommes ne différaient pas significativement pour tous les gènes de virulence des ExPEC détectés, à l'exception de papC qui était significativement (P ≤ 0,05) plus répandu parmi les isolats des hommes (16,6 %) que parmi les isolats des femmes (6,6 %). Français Dans les isolats des femelles et des mâles, les gènes de virulence les plus répandus étaient fimH (97,5 % contre 100 %, respectivement) et iucC (52,0 % contre 55,9 %, respectivement), tandis que les moins répandus étaient sfa/foc (0 % chacun) et hly (0,82 % contre 0 %, respectivement). De plus, les gènes de virulence étaient concentrés dans les isolats regroupés dans le groupe B2.
Chez les femelles et les mâles, un pourcentage élevé d'isolats fécaux commensaux dominants d'E. coli provenant d'Irakiens de la ville d'Al-Kut se sont regroupés dans le phylogroupe A, suivi des groupes B1 et D, tandis que le groupe B2 était rare. De plus, les souches fécales dominantes présentant des caractéristiques ExPEC étaient beaucoup moins répandues.