Journal de la technologie microbienne et biochimique

Abstrait

La phylogénie des différentes souches d'Helicobacter pylori n'a pas pu être expliquée par le gène de l'ARNr 16S en raison de la forte similitude de la séquence génétique entre les souches

Wenfa Ng

La compréhension des liens évolutifs entre les différentes souches d'une espèce a permis d'identifier les différences spécifiques à chaque souche qui peuvent être utiles pour le diagnostic et le traitement des maladies. En règle générale, ce typage au niveau de la souche est complété par des analyses moléculaires telles que le séquençage de l'ADN et l'analyse de l'arbre phylogénétique. Ce travail utilise des données publiques sur la séquence du gène 16S rRNA de différentes souches d' Helicobacter pylori pour aider à tracer l'arbre phylogénétique qui décrit les trajectoires évolutives des différentes souches. Les résultats de l'alignement de séquences multiples révèlent un niveau élevé de conservation de la séquence du gène 16S rRNA entre les souches. Cela se traduit ensuite par une structure d'arbre phylogénétique qui suggère des relations évolutives très étroites entre les différentes souches, à l'exception d'une souche aberrante. Même dans le cas de la souche aberrante, sa distance évolutive par rapport aux autres frères n'était pas non plus grande. Dans l'ensemble, les résultats obtenus dans cette étude indiquent que le gène 16S rRNA ne peut pas capturer la phylogénie au niveau de la souche entre différentes souches de la même espèce et suggèrent des efforts pour élucider cet effet phylogénétique dans d'autres gènes de l'espèce. De tels gènes peuvent être impliqués dans la virulence au cours de la pathogénèse chez l'homme et peuvent donc être soumis à une pression évolutive et à une sélection naturelle plus élevées.