Journal de pathologie végétale et de microbiologie

Abstrait

La polymérase et la protéine de capside ont été ciblées et caractérisées dans le virus de la jaunisse nanisante du blé, les acides aminés déduits ont été comparés aux membres du groupe dans Genbank

Hoda Waziri*

Les plants de blé cultivés en Égypte présentent des symptômes de type viral. La jaunisse nanisante du blé a été caractérisée à l'aide de la technique RT-PCR. Deux régions codantes de l'isolat du virus de la jaunisse nanisante du blé (WYDV-PAV) pour le gène de la polymérase (P1) situé dans le cadre de lecture ouvert (ORF1) et le gène de la protéine de capside situé dans le cadre de lecture ouvert (ORF3) ont été ciblées. Deux
ensembles d'amorces spécifiques ont été conçus selon l'isolat BYDV-PAV dans Genbank. Les fragments d'ADN de l'ORF1 et de l'ORF3 d'un isolat égyptien de BYDV-PAV ont été clonés et séquencés. La séquence contenait un ORF1 complet codant pour le gène de la polymérase virale. Il comprend 910 nt de longueur et code une chaîne polypeptidique prédite de 303 acides aminés avec un M(r) de 34,67. Français D'autre part, les données de séquence pour l'ORF3 codant pour la protéine d'enveloppe virale ont révélé qu'elle mesurait 603 pb de long et codait une protéine prédite de 200 acides aminés, avec un poids moléculaire de 21,96 KDa. Cependant, l'arbre d'homologie phylogénétique basé sur les multiples alignements de séquences de l'isolat égyptien Egy-Wz avec les isolats disponibles dans NCBI GenBank a révélé que le gène de la polymérase partageait 76,5 % à 99 % et 71,6 % à 93,2 % d'identités de séquence au niveau des acides aminés et des nucléotides avec les isolats 05GG2, PAV 014 et PAV014, PAV-Aus respectivement. D'autre part, le gène de la protéine d'enveloppe présentait une similarité de séquence de 85,1 % à 99,5 % et de 89,7 % à 99,2 % avec deux isolats 06KM14 et 05GG2 au niveau des acides aminés et des nucléotides, respectivement.