Ilana Zilber-Rosenberg et Eugène Rosenberg
Les prébiotiques et les probiotiques s'inscrivent dans le cadre du concept d'hologénome qui postule que l'holobionte (hôte plus tous ses micro-organismes associés) avec son hologénome, agissant en consortium, affecte tous les aspects de la forme physique de l'holobionte (adaptation, survie, développement, croissance et reproduction) et de son évolution. La variation de l'holobionte peut être provoquée par l'amplification de microbes endogènes et par l'acquisition de nouvelles souches. Les prébiotiques et les probiotiques fonctionnent selon ces mécanismes et peuvent provoquer des changements rapides dans la diversité du microbiote, qui peuvent non seulement bénéficier (ou nuire) à l'holobionte à court terme, mais peuvent également être transmis à la progéniture et conduire à des coopérations et des changements durables qui ne peuvent pas encore être prédits. Le rôle des bactériophages dans la modération des effets des prébiotiques et des probiotiques est également discuté.