Journal of Aquaculture Research & Development

Abstrait

Analyse protéomique des isolats sensibles et résistants d'Escherichia coli pour comprendre la ou les cibles d'une biomolécule cyanobactérienne Hapalindole-T

Manoj Kumar Tripathi, Maheep Kumar, Deepali S, Ravi Kumar Asthana et Subhasha Nigam

Une biomolécule à large spectre Hapalindote-T, issue d'une cyanobactérie Fischerella sp. colonisant l'écorce de l'arbre Neem, a été utilisée comme cible en utilisant Escherichia coli. Les extraits cellulaires de Hap-TS (sensible) et Hap-TR (résistant) d'E. coli ont été soumis à 2DGE. Les spots protéiques (sélectionnés) avec une expression altérée ont été analysés par LC-MS. Les données obtenues ont été comparées à la base de données d'E. coli. Dix-sept protéines ont été trouvées avec un niveau d'expression altéré. Trois protéines membranaires, OmpP, Agn43A et LysU, trouvées dans la souche Hap-TS étaient absentes dans la souche Hap-TR. Cependant, quatorze protéines, AspA, GlpK, LpdA, HslU, GlnA, SucB, YihT, GalF, MDH, RfbB, RmlB, AcrAB, FabB et GapA, liées à certaines voies métaboliques de la cellule et surproduites dans l'extrait de la souche Hap-TR. Les dix-sept protéines examinées étaient liées à des voies métaboliques vitales, notamment la protéine membranaire (Omp P), chez E. coli. Les résultats ont indiqué que ces protéines pourraient être la cause de la résistance chez E. coli. Ces résultats suggèrent que les protéines/enzymes surproduites dans la souche résistante pourraient être une stratégie de survie sous stress Hap-T et pourraient être utilisées comme protéine de signature pour le développement de nouveaux médicaments.