Abdelkrim Khadir et Ali Tiss
La détection précoce du cancer est la clé pour obtenir de meilleurs résultats en matière d'intervention thérapeutique. La plupart des outils de dépistage et de diagnostic de routine du cancer manquent de sensibilité et/ou de spécificité et sont parfois invasifs. Les technologies protéomiques sont récemment très prometteuses dans la recherche de nouveaux biomarqueurs cliniques pour la détection et le diagnostic précoces du cancer ainsi que pour la découverte de nouvelles cibles thérapeutiques à partir d'échantillons biologiques accessibles. Elles ont également le potentiel de contribuer à une meilleure compréhension de la biologie du cancer et d'aider à prendre les bonnes décisions thérapeutiques pour les patients. Alors que certaines approches protéomiques, telles que celles utilisées pour identifier les protéines et analyser leur interaction et leur fonction, sont bien établies, d'autres, comme le profilage de l'expression des protéines pour la découverte et la validation de biomarqueurs, souffrent encore de problèmes de robustesse et de reproductibilité avant de pouvoir trouver leurs applications cliniques dans le cancer. Dans cette perspective, nous essayons ici de résumer brièvement les différentes approches et techniques protéomiques basées sur la spectrométrie de masse (MS) utilisées dans les études sur le cancer, puis nous discutons de la complexité et des étapes critiques de la manipulation et du traitement des échantillons biologiques, et enfin, nous nous concentrons sur les stratégies et techniques les plus prometteuses qui peuvent raccourcir le chemin du laboratoire au chevet du patient en protéomique du cancer. Il s'agit notamment des approches protéomiques dirigées, telles que le ciblage des tissus pathologiques et des compartiments subcellulaires, l'analyse des modifications post-traductionnelles de sous-ensembles sélectionnés de protéines, la quantification sélective du suivi des réactions et la stratégie d'intégration « omique ». L'imagerie basée sur la MS des biopsies tissulaires et les techniques de résonance plasmonique de surface couplées à la MS seront également abordées car elles sont apparues récemment comme des applications prometteuses pour la découverte et la validation de biomarqueurs.