Journal of Aquaculture Research & Development

Abstrait

Détection rapide de l'infection à Flavobacterium columnare chez les poissons par réaction en chaîne par polymérase spécifique à l'espèce

Avijit Patra, Sudeshna Sarker, Sayani Banerjee, Harresh Adikesavalu, Debadyuti Biswas et Thangapalam Jawahar Abraham

Cette étude décrit la détection rapide de la maladie columnaris induite par Flavobacterium columnare chez des poissons d'eau douce d'élevage, à savoir Labeo rohita, Ctenopharyngodon idella, Puntius sp. et Anabas testudineus par réaction en chaîne par polymérase spécifique à l'espèce . La décoloration des branchies, les zones nécrotiques jaunes, les taches blanches sur les branchies, le dos en selle et l'érosion des écailles étaient les signes cliniques prédominants chez tous les poissons malades, à l'exception de Puntius sp., qui présentait des signes typiques d'ulcère à la base de la nageoire dorsale. Sur les neuf cas de maladie, huit se sont révélés positifs à columnaris par PCR spécifique à l'espèce indépendante de la culture. Les deux ensembles d'amorces spécifiques de F. columnare tels que ColF, ColR et Col72F, Col1260R ont donné des amplicons d'environ 675 pb et 1000 pb, respectivement, dans tous les échantillons positifs. Phylogénétiquement, les séquences nucléotidiques des échantillons positifs, à savoir C1 et RG1, formaient un groupe monophylétique avec F. columnare, confirmant ainsi l' infection comme étant columnaris.