Journal de pathologie végétale et de microbiologie

Abstrait

Développements récents dans la sélection génomique pour la sélection végétale quantitative de gènes mineurs résistants aux maladies

Dagnachew Bekele, Kassahun Tesfaye, Asnake Fikre

Pour accélérer le développement de variétés améliorées, la sélection végétale assistée par génomique devient un outil important. Avec la sélection traditionnelle et la sélection assistée par marqueurs, plusieurs avancées ont été réalisées dans la sélection pour la résistance aux maladies. La plupart des recherches sur la résistance aux maladies se sont concentrées sur les gènes majeurs de résistance aux maladies, qui sont très efficaces bien que très vulnérables à la dégradation lors de changements rapides dans les races pathogènes. En revanche, la sélection pour la résistance quantitative aux gènes mineurs peut produire des variétés végétales plus durables, bien qu'elle soit très lente et difficile. Comme l'architecture génétique de la résistance aux maladies des plantes passe d'un seul gène majeur R à de nombreux gènes mineurs quantitatifs, l'approche la plus appropriée pour la sélection végétale moléculaire est la sélection génomique (GS) plutôt que la sélection assistée par marqueurs ou la sélection conventionnelle. Avec l'avènement de nouveaux outils génomiques, la GS est devenue l'une des approches les plus importantes pour prédire les performances du génotype afin d'améliorer les caractères quantitatifs génétiquement complexes. Par conséquent, la GS contribue à accélérer le taux de gain génétique dans la sélection en utilisant des données de séquence du génome entier pour prédire la valeur de reproduction de la progéniture. La sélection GS pour la résistance quantitative nécessitera donc des modèles de prédiction du génome entier et une méthodologie de sélection telle que mise en œuvre pour les caractères complexes classiques. Avec la mise en œuvre de la GS pour le rendement et d'autres caractères économiquement importants, des profils de marqueurs du génome entier sont disponibles pour l'ensemble des lignées de sélection, permettant la sélection génomique pour la résistance aux maladies sans coût direct supplémentaire. Par conséquent, les développements récents dans le domaine de la GS, notamment les modèles GWAS de novo GS + à deux flux (GS+) et GS pour le niveau combiné le plus élevé de résistance quantitative avec des individus de gènes R (gène QR + R), devraient faire progresser davantage la sélection végétale résistante aux maladies et sont brièvement discutés.