Technologie génétique

Abstrait

Régulation de l'expression du VEGF-A dans les cellules endothéliales par activation ou silençage génique transcriptionnel : analyse de la réponse transcriptionnelle à l'échelle du génome

Tiia Husso, Mikko P. Turunen et Seppo Yla-Herttuala

Le facteur de croissance endothélial vasculaire (VEGF-A) est un gène important dans de nombreuses maladies, telles que le cancer et les maladies cardiovasculaires. Nous avons étudié les changements dans les profils d'expression génique à l'échelle du génome dans les cellules endothéliales murines lorsque l'expression du VEGF-A était modulée épigénétiquement à l'aide de petits ARN en épingle à cheveux ciblés par le promoteur (shRNA). Les cellules endothéliales murines ont été transduites avec des vecteurs lentiviraux exprimant des shRNA complémentaires du promoteur du gène. Des expériences de matrice d'expression génique ont été menées pour étudier les changements d'expression d'ARNm à l'échelle du génome causés par la régulation à la hausse et à la baisse du VEGF-A. Il y avait plusieurs centaines de gènes exprimés de manière différentielle selon les critères statistiques appliqués. Nous avons remarqué que les effets de la régulation à la baisse du VEGF-A étaient beaucoup plus répandus que les effets de la régulation à la hausse du VEGF-A. Notre analyse in silico a révélé qu'un certain nombre de processus biologiques différents sont altérés en raison des effets épigénétiques sur l'expression du VEGF-A. L'un des principaux régulateurs de la réponse transcriptionnelle médiée par le VEGF-A s'est avéré être le facteur de transcription ATF-4. Il s'agit de la première étude montrant la réponse transcriptionnelle à la modification épigénétique de l'expression du VEGF-A dans les cellules endothéliales. La régulation épigénétique des gènes représente un mécanisme naturel de régulation des gènes et ces résultats révèlent des implications jusqu'alors inconnues de la régulation du VEGF-A dans les cellules endothéliales.