Journal de la technologie microbienne et biochimique

Abstrait

Extraction d'ARN à partir de la levure Candida parapsilosis Sensu Stricto à l'aide de deux méthodes commerciales basées sur la purification par colonnes de silice

Rodríguez ML, Rosa AC et Jewtuchowicz VM

L'étude de l'expression des gènes nécessite l'obtention d'ARN de bonne qualité. Différentes méthodes d'extraction d'ARN ont été décrites, mais la qualité et le rendement de l'ARN peuvent varier selon les techniques et les espèces biologiques étudiées. A ce jour, il n'existe pas de méthode standardisée d'extraction et de purification d'ARN à partir de levures du genre Candida . Les quelques articles disponibles sur le sujet s'appliquent principalement aux champignons filamenteux et ont produit de mauvais résultats pour les techniques d'extraction basées sur des méthodes IVD manuelles ou internes. L'objectif de cette étude était donc de comparer deux systèmes commerciaux d'extraction et de purification d'ARN utilisant des colonnes de silice (Qiagen et Zymo Research) avec Candida parapsilosis sensu stricto comme organisme modèle. Cette levure a été identifiée dans des articles récents comme la deuxième espèce de Candida la plus fréquemment isolée dans la cavité buccale. Au cours de la dernière décennie, elle a fait l'objet d'un intérêt médical croissant car elle est l'une des principales causes de candidémie chez les adultes et les nouveau-nés prématurés. Au vu de ce contexte, nous considérons que l'étude du transcriptome de Candida parapsilosis sensu stricto et de ses variations en fonction des changements environnementaux est une priorité. Dans cette étude expérimentale, 19 isolats fongiques ont été traités avec Qiagen et 17 isolats avec Zymo Research. Les résultats suggèrent que le tampon de lyse RLT de Qiagen est essentiel pour obtenir un produit ARN de meilleure qualité.