Technologie génétique

Abstrait

sdRNA : siRNA avec une graine d'ADN pour une interférence ARN efficace et spécifique au gène cible

Kumiko Ui-Tei

L'interférence ARN (ARNi), un processus par lequel les petits ARN interférents (siRNA) induisent un silençage génique post-transcriptionnel spécifique à une séquence, est communément reconnue comme un outil puissant non seulement pour la génomique fonctionnelle mais aussi pour les applications thérapeutiques. Pour obtenir une fonction précise du gène cible et des applications thérapeutiques réussies, il est nécessaire de sélectionner un gène cible efficace et spécifique

siRNA avec des effets hors cible minimes. Nous avons découvert que la capacité à induire des effets hors cible sur des gènes non intentionnels est fortement corrélée à la stabilité thermodynamique du duplex formé entre la région d'ensemencement (positions 2 à 8 à partir de l'extrémité 5' du brin guide siRNA) et l'ARNm cible. Conformément à cette propriété, nous avons découvert que l'ARNsi chimérique ADN-ARN (chiRNA) avec des désoxyribonucléotides dans les huit nucléotides proximaux 5' du brin guide et les nucléotides complémentaires dans le brin passager n'exerçait pratiquement aucun effet hors cible en raison de la faible stabilité du duplex ADN-ARN dans l'appariement de bases graine-cible. Cependant, les activités ARNi correspondantes pour les gènes cibles primaires ont également été réduites d'un dixième en moyenne par les substitutions d'ADN. Ici, nous rapportons que les siRNA avec sept désoxyribonucléotides exclusivement dans la région d'ensemencement (sdRNA) peuvent présenter une spécificité de cible efficace, mais une activité ARNi réduite par l'effet hors cible.