Génétique héréditaire : recherche actuelle

Abstrait

Études sur la caractérisation moléculaire du gène DREB dans le riz Indica (Oryza sativa L.)

Jadhao KR, Samal KC, Pradhan SK et Rout GR

Un certain nombre de gènes candidats potentiels (CG) ont été identifiés par des approches transcriptomiques et transgéniques impliqués dans les réponses adaptatives à la sécheresse chez les céréales. L'un de ces gènes conférant une tolérance à la sécheresse est la famille de gènes DREB. L'exploration de la variation génétique/allélique au sein de la famille de gènes DREB est une condition préalable importante pour une meilleure compréhension de la tolérance au stress. La présente étude vise à étudier la variation allélique de la séquence nucléotidique au sein du gène DREB de différents cultivars de riz nécessaires au programme d'amélioration des cultures. Dix cultivars de riz de haute et de basse altitude ont été utilisés pour la caractérisation moléculaire et l'exploration d'allèles. Les résultats ont montré que le gène DREB a été trouvé dans tout le matériel génétique testé et soumis à la NCBI GenBank (numéros d'accès KF 545561 à KF 545569). L'analyse bioinformatique a montré une identité à 100 pour cent avec le domaine de liaison à l'ADN AP2 de 59 acides aminés qui présentait trois feuillets conservés avec des résidus conservés de valine 14e et d'acide glutamique 19e. Français Le domaine AP2 de la protéine DREB putative s'est avéré riche en acides aminés alanine (17,6 %) et arginine (15,7 %) avec une masse moléculaire prédite de 5,89 kDa et un point isoélectrique (pI) de 10,38. Il est observé que les séquences nucléotidiques du gène DREB ont été vérifiées par analyse du polymorphisme de l'ADN, parmi lesquelles 196 sites invariables (monomorphes) et 8 sites variables (polymorphes), c'est-à-dire ségrégatifs, ont été identifiés, dont 9 nombres de mutations et 5 haplotypes. La diversité des haplotypes (gènes) était de 0,756 ; la variance et l'écart type de diversité étaient respectivement de 0,01678 et 0,130. Le résultat a montré que la variété 'Khandagiri' présentait une similarité de 97,5 % avec toutes les accessions du gène DREB du riz et une divergence évolutive de 0,036 % avec l'accession AK121956 présente dans la base de données. Cela pourrait avoir amélioré la capacité du gène DREB en tant que facteur de transcription et avoir conduit à une meilleure capacité d'adoption et de tolérance du cultivar pendant la sécheresse.