Journal of Petroleum & Environmental Biotechnology

Abstrait

Diversité taxonomique et potentiel de biodégradation des bactéries isolées des réservoirs pétroliers d'un bassin offshore du sud du Brésil

Patrícia F. Lopes-Oliveira, Suzan P. Vasconcellos, Célio FF Angolini, Georgiana F. da Cruz, Anita J. Marsaioli, Eugênio V. Santos Neto et Valéria M. Oliveira

Cette étude visait la caractérisation taxonomique d'une collection de 98 bactéries isolées d'échantillons de pétrole et d'eau de formation provenant de réservoirs pétroliers du bassin de Campos (Brésil), ainsi que l'évaluation de leur potentiel de dégradation des biomarqueurs pétroliers. L'ADN génomique extrait de tous les isolats a été utilisé dans des réactions de PCR pour l'amplification du gène 16S rRNA et le criblage ultérieur par ARDRA (Amplified Ribosomal DNA Restriction Analysis), afin de détecter des groupes taxonomiques potentiellement distincts. Un séquençage supplémentaire du gène 16S rRNA et une analyse phylogénétique de 39 isolats représentant différents ribotypes ont révélé que ces isolats appartenaient à 10 genres différents, englobant Marinobacter, Halomonas, Citreicella, Stenotrophomonas, Achromobacter, Bacillus, Staphylococcus, Micrococcus, Kocuria et Streptomyces, affiliés aux trois phylums Proteobacteria, Firmicutes et Actinobacteria. L'analyse RAPD a permis de distinguer les isolats au niveau infraspécifique, permettant l'identification de 45 profils de bandes génétiques distincts. Les résultats chromatographiques ont montré la préférence de toutes les bactéries pour la biodégradation de l'acide nonadécanoïque et du squalane lorsqu'elles sont cultivées dans un mélange de biomarqueurs. Les résultats de cette étude apportent un éclairage supplémentaire sur la taxonomie de la fraction cultivée des communautés microbiennes des réservoirs pétroliers brésiliens et peuvent offrir des outils potentiels pour une application future dans les processus de bioremédiation.