Clinical & Medical Biochemistry

Abstrait

Formation de ponts tétrasulfures (TTSB) : une structure intermédiaire extraordinaire dans l'architecture et la dynamique de la molécule gp120 du VIH-1

Harry F. Crèvecoeur

Gp120, l'une des molécules qui exécutent l'entrée du virus VIH dans les cellules CD4+, possède un certain nombre de ponts disulfures allostériques. Dans cette étude, nous explorons la dynamique de ces ponts disulfures potentiels dans la configuration 3D (basée sur la cristallographie) et les analyses DBA de l'UNSW de divers cristaux de gp120. Les données révèlent l'existence d'un pont tétrasulfure (tétrasulfure) (TTSB) qui, avec un pont disulfure, maintient deux feuillets bêta perpendiculaires (à savoir V3 et V4) approximés dans l'architecture du gp120 tout en permettant un transfert d'énergie sûr entre les liaisons allostériques. Les analyses de plusieurs cristaux de gp120 révèlent que l'existence du TTSB est davantage un intermédiaire qu'un repère constant, ce qui implique des fonctions plus complexes que de simples attributs structurels. Ce pont tétrasulfure, observé dans divers cristaux de gp120, dans diverses souches et clades du VIH-1, est démontré par divers logiciels de rendu et certains sont également détectés, signalés et caractérisés par le moteur UNSW Disulfide Bond Analysis (DBA). Ce pont tétrasulfure relie la liaison allostérique Cys296-Cys331 à Cys385-Cys418, parfois sous la forme CYS331:SG-CYS385:SG, et parfois sous la forme CYS331:SG-CYS418:SG. De plus, dans les cristaux 3TIH, 4LSR et 4R4N, nous avons également observé un état intermédiaire du pont tétrasulfure où il présente une formation triangulaire dans laquelle l'atome de soufre CYS331:SG se lie simultanément à CYS385:SG et CYS418:SG, ce qui représente un intermédiaire important dans la dynamique fonctionnelle de la molécule gp120. La présence de cette structure extraordinaire (TTSB) suggère des perspectives intrigantes sur la conception et la mécanique multifonctionnelle ainsi que sur certaines fragilités complexes de la molécule gp120, exposant une nouvelle cible pour la thérapie antivirale.