Journal de pathologie végétale et de microbiologie

Abstrait

L'exoribonucléase 2 5´ → 3´ comme cible potentielle pour le développement de fongicides destinés à lutter contre la maladie de Panama

Maldonado Bonilla LD et Calderón-Oropeza MA

Une épidémie de Fusarium oxysporum f. sp. cubense Tropical Race 4 menace actuellement la production mondiale de bananes. En raison de la nature clonale des bananiers commerciaux, la sélection de cultivars résistants ne semble pas faisable ; par conséquent, des approches alternatives pour la protection des cultures doivent être développées. L'exoribonucléase 5' → 3' XRN2/RAT1 est impliquée dans la dégradation de l'ARN 5' → 3'. Des études fongiques avec XRN2 et des mutants conditionnels ont illustré le rôle crucial de cette enzyme, suggérant que XRN2 devrait être considérée comme une cible pour la recherche de nouveaux inhibiteurs qui pourraient être utilisés comme fongicides pour contrôler la maladie de Panama. Notre analyse in silico de la race tropicale 4 XRN2 (FocTR4XRN2) a révélé des caractéristiques de l'exoribonucléase 5' → 3' telles que le domaine catalytique qui reconnaît l'ARN 5'-monophosphorylé et catalyse le clivage traité des mononucléotides. Une cavité délimitée montrant le potentiel d'absorption du substrat semble susceptible d'interagir avec de petites molécules qui pourraient inhiber son activité. Le domaine catalytique de FocTR4XRN2 abrite un motif CCHC, qui est conservé dans les protéines orthologues des champignons filamenteux mais absent des levures. Les résidus impliqués dans l'interaction avec la pyrophosphohydrolase RAI1 sont également conservés. L'amarrage moléculaire révèle l'interaction potentielle de FocTR4XRN2 avec l'inhibiteur naturel adénosine 3', 5' bisphosphate, et suggère que cette approche est fiable pour rechercher de nouveaux inhibiteurs enzymatiques qui pourraient aider à supprimer la progression des agents responsables de la maladie de Panama.