Journal des maladies infectieuses et diagnostic

Abstrait

L'impact des cycles de congélation-décongélation sur l'intégrité des fluides de culture virale du SRAS-CoV-2 et des échantillons cliniques résiduels dans les tests d'antigènes ou d'acides nucléiques

Hajirah Noor Hussain, Hali Weeks, Derek Zhou, Divya Joseph, Brooke Lam, Haidong Xu, Chushi Zhang, Keqin Gregg, Wenli Zhou*

La conservation à des températures ultra-basses est une référence pour le stockage à long terme de nombreux types d'échantillons cliniques, y compris le virus SARS-CoV-2. Les échantillons congelés peuvent être facilement transportés et testés ultérieurement. De plus, les échantillons congelés non identifiés sont des ressources pour de nombreuses études précliniques ou cliniques. Il est donc crucial de comprendre si les cycles de congélation-décongélation (FTC) peuvent nuire aux performances du test SARS-CoV-2 lorsque des échantillons congelés sont testés. Certaines études préliminaires suggèrent que les FTC ont augmenté le seuil de cycle (Ct) de la PCR en temps réel à transcription inverse (RT-PCR ou RT-qPCR), indiquant la dégradation potentielle de l'acide nucléique du SARS-CoV-2 après les FTC, tandis que les autres n'ont signalé aucun changement significatif dans les acides nucléiques du SARS-CoV-2 après les FTC. De plus, l'impact des FTC sur les performances du test antigénique du SARS-CoV-2 est rarement rapporté.

Dans cette étude, nous avons effectué des tests appariés d'acide nucléique et d'antigène rapide sur les mêmes échantillons pour étudier et comparer directement l'effet des FTC sur les performances de deux types de tests. Des échantillons de fluides de culture virale inactivés et des échantillons de résidus cliniques ont été étudiés. Nos résultats ont montré que les FTC avaient des effets négatifs minimes sur les performances du test rapide d'antigène SARS-CoV-2, et les résultats du test sont restés largement cohérents tout au long des FTC, tandis que les valeurs Ct de RT-PCR ont augmenté avec l'augmentation du nombre de FTC. De plus, nos données ont également démontré que le SARS-CoV-2 est mieux préservé dans le milieu de transport viral (VTM) que dans le tampon phosphate salin (PBS) pendant les FTC en ce qui concerne les tests d'acide nucléique.