Kathryn R Stein, Bennett J Giardina, Hui-Ling Chiang *
La sécrétion de protéines est un processus fondamental dans toutes les cellules vivantes. Les protéines qui contiennent le signal ER sont sécrétées par la voie classique, tandis que les protéines sans la séquence ER sont sécrétées par la voie non classique. Des preuves récentes indiquent qu'un grand nombre de protéines sans signal, notamment des enzymes métaboliques, des facteurs de transcription, des facteurs de traduction, des protéines de choc thermique et des protéines antioxydantes, sont sécrétées par une variété de cellules allant des bactéries à l'homme. De plus, la sécrétion d'enzymes gluconéogènes a été observée dans les bactéries, les champignons, les parasites et les cellules de mammifères. Les enzymes gluconéogènes sont sécrétées dans le périplasme lorsque Saccharomyces cerevisiae est cultivé dans un environnement à faible teneur en glucose. La distribution des enzymes gluconéogènes dans le périplasme/la fraction extracellulaire de Saccharomyces cerevisiae a été observée par immuno-TEM, confirmée par un protocole d'extraction et identifiée dans une étude protéomique à grande échelle. On s'attend à ce qu'il existe d'autres protéines dépourvues de la séquence signal ER et utilisant la voie non classique pour être sécrétées. En effet, 92 protéines présentes dans la fraction extracellulaire ont été identifiées à l'aide de la protéomique et plus de 95 % des protéines n'ont pas la séquence ER. Ainsi, la voie non classique est la principale voie de sécrétion des protéines chez Saccharomyces cerevisiae. Cet article de synthèse se concentre sur l'utilisation de plusieurs techniques, notamment l'immuno-TEM, un protocole d'extraction et la protéomique, pour identifier les protéines présentes dans la fraction extracellulaire de Saccharomyces cerevisiae, et pour comparer l'ensemble de données produites dans la levure avec d'autres études de sécrétomes réalisées sur une gamme d'organismes allant des bactéries aux cellules humaines. Les protéines courantes comprennent les enzymes métaboliques, les protéines de choc thermique, les protéines antioxydantes et les facteurs de traduction. Par conséquent, la sécrétion de ces protéines est largement observée dans toutes les espèces.