Pharmaceutica Analytica Acta

Abstrait

Études vibrationnelles et calculs DFT de la cytosine, de la thiocytosine et de leurs cations et anions

Yadav RA, Rashmi Singh et Mayuri Srivastava

Des calculs DFT ont été effectués pour calculer les géométries moléculaires optimisées, les charges APT et les fréquences vibrationnelles fondamentales ainsi que leurs intensités IR correspondantes, les activités Raman et les rapports de dépolarisation des bandes Raman pour les molécules neutres Cyt et TCyt et leurs cations et anions en utilisant la méthode DFT/B3LYP avec l'ensemble de base 6-311++G** en utilisant le logiciel Gaussian-03. TCyt, Cyt+ et TCyt+ présentent des structures planes et appartiennent à la symétrie du groupe ponctuel Cs tandis que Cyt, Cyt- et TCyt- possèdent des structures non planes avec une symétrie du groupe ponctuel C1. Une analyse conformationnelle a été réalisée pour obtenir les configurations les plus stables de ces molécules. Les modes normaux de vibration pour toutes les espèces ont été attribués sur la base des PED obtenus à partir de l'analyse des coordonnées normales à l'aide du logiciel GAR2PED. Des informations sur la taille, la forme, la distribution de densité de charge et le site de réactivité chimique de la molécule ont été obtenues en cartographiant l'isosurface de densité électronique avec les surfaces de potentiel électrostatique moléculaire (MEP). L'écart énergétique entre HOMO et LUMO de Cyt est de 5,2963 eV et celui de TCyt de 5,0062 eV.