Journal of Data Mining en génomique et protéomique

Abstrait

Analyse de la complexité et de l'entropie de l'ADN méthyltransférase

Xiaoli Xie, Ying Yu, George Liu, Zhifa Yuan et Jiuzhou Song

Contexte : L'application des informations de complexité sur la séquence d'ADN et les protéines dans les processus biologiques est bien établie dans cette étude. Les séquences disponibles pour le gène DNMT1 ont été minutieusement explorées dans les complexités d'information. Le gène DNMT1 est une méthyltransférase de maintenance responsable de la copie des modèles de méthylation de l'ADN sur les brins filles pendant la réplication de l'ADN dans différentes espèces. Résultats : Nous avons découvert que l'entropie du gène DNMT1 dans différentes espèces dépend de la composition en bases de l'ADN et que sa complexité chez les mammifères est plus faible dans les introns que dans les régions codantes. Nous avons également démontré les impacts de l'entropie sur les domaines et les non-domaines du gène DNMT1. Les résultats des séquences d'ADN et de protéines ont indiqué que l'évolution de l'ADN a tendance à devenir complexe. Le plus intéressant est que les changements de méthylation du gène au cours du vieillissement dans un modèle de poussin unique ont montré des caractéristiques d'entropie induites par le vieillissement, ce qui peut donner une explication des processus de vieillissement. Conclusion : En résumé, la complexité informationnelle du gène DNMT1 est liée à sa composition génomique, qui est ainsi associée au traitement évolutif et au vieillissement, même si le mécanisme intrinsèque n'a pas encore été étudié.