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Abstrait
Extraction du génome et analyse transcriptionnelle des gènes de bactériocine dans Enterococcus faecium CRL1879
Suárez N, Bonacina J, Hebert EM et Saavedra L*
Parmi 151 isolats bactériens provenant de neuf fromages artisanaux, Enterococcus faecium CRL 1879 a montré une activité antibactérienne contre le pathogène d'origine alimentaire Listeria monocytogenes. L'isolat a produit un composé sensible à la protéinase K dans le surnageant acellulaire. L'analyse du génome a démontré la présence de groupes de gènes biosynthétiques d'entérocine A, d'entérocine B, d'entérocine P, d'entérocine SE-K4-like et d'entérocine X. Les séquences nucléotidiques codant pour une bactériocine putative à deux composants ont été détectées à l'aide d'outils bioinformatiques, ici nommée entérocine CRL1879αβ. Une analyse transcriptionnelle de tous les gènes de bactériocine par analyse quantitative en temps réel (qRT-PCR) a révélé la transcription de chaque gène d'entérocine à différents niveaux. Enfin, une analyse de la distribution des gènes de bactériocine dans 251 bioprojets d'E. faecium a été réalisée et comparée à celles identifiées dans E. faecium CRL1879. L’analyse discriminante a démontré que les gènes de bactériocine sont largement distribués parmi les Enterococcus, indépendamment de l’origine de la souche.
Les résultats présentés dans cet article représentent une découverte unique puisqu’il s’agit de la première démonstration d’une souche d’E. faecium isolée d’un fromage artisanal avec la machinerie génétique complète pour produire six bactériocines de classe II et une de classe III.