Biochimie & Biochimie Analytique

Abstrait

Comment l'alpha-lactalbumine humaine reconnaît l'ADN et l'ARN

Nevinsky GA, Alinovskaya LI, Ivanisenko NV, Soboleva SE et Sedykh SE

Français L'α-lactalbumine (LA) humaine a une fonction importante dans les cellules mammaires, elle active les caspases impliquées dans l'apoptose. Le complexe LA interagit avec l'ADN dans les cellules tumorales avec des histones et altère la structure de la chromatine. Il n'existe aucune donnée sur la manière dont LA reconnaît l'ADN et interagit avec les histones et l'ADN de la chromatine. L'approche de l'augmentation progressive de la complexité du ligand a été utilisée pour estimer la contribution relative de chaque unité nucléotidique d'ADN à son affinité totale pour la LA humaine. Il a été démontré que les ligands minimaux du site de liaison à l'ADN de la LA sont l'orthophosphate et tous les dNMP et rNMP (Kd=(5,0-43)×10-5). Une contribution maximale à l'affinité totale a été observée pour trois unités nucléotidiques de tous les (pN)n avec une diminution significative de l'ordre 1>2>3, à n=4-6 elle était remarquablement plus faible et à n ≥ 6-7 toutes les dépendances de -logKd sur n ont atteint des plateaux. Les ligands double brin (pN)n ont montré une affinité significativement plus faible que les ligands simple brin. Les paramètres thermodynamiques caractérisant la contribution spécifique de chaque liaison nucléotidique (pN)1-6 (ΔGo) à leur affinité totale pour LA ont été estimés. Le modèle spatial du complexe LA-ADN a été calculé. La séquence protéique LA présente une homologie avec celles de cinq histones (H1-H4) impliquées dans les interactions du noyau de la chromatine entre elles et leur complexe avec l'ADN. On suppose que l'homologie peut être la principale raison de l'interaction de LA avec l'ADN de la chromatine, conduisant à une rupture de sa structure, ainsi qu'à la liaison appropriée des histones entre elles et avec l'ADN.