Biochimie & Biochimie Analytique

Abstrait

Identification de cibles médicamenteuses potentielles et de candidats vaccins contre les agents pathogènes responsables de l'athérosclérose

Kanipakam Hema, Vani Priyadarshini I, Dibyabhaba Pradhan, Manne Munikumar, Swargam Sandeep, Swargam Sandeep, Natarajan Pradeep, Suchitra MM et Amineni Umamaheswari

L'athérosclérose est une maladie inflammatoire chronique des artères, responsable d'accidents vasculaires cérébraux (AVC) et cardiovasculaires (cérébraux) avec une morbidité et une mortalité élevées dans le monde entier. Des agents pathogènes infectieux tels que Chlamydophila pneumoniae, Porphyromonas gingivalis et Helicobacter pylori sont associés à la maladie dans des études épidémiologiques récentes. Par conséquent, l'identification de cibles médicamenteuses communes et de candidats vaccins contre ces trois agents pathogènes serait essentielle pour le traitement et la gestion de l'athérosclérose. Chlamydophila pneumoniae a été sélectionnée comme organisme de référence en raison de son rôle prédominant dans l'athérosclérose. En mettant en œuvre une approche génomique comparative, une approche génomique soustractive, une analyse des voies métaboliques, une analyse de la flore intestinale non homologue et une analyse de recherche de domaine, 35 cibles médicamenteuses putatives communes ont été identifiées contre les agents pathogènes de l'athérosclérose. Des études de localisation subcellulaire ont été réalisées et ont identifié la protéine UvrABC comme candidat vaccin. L'analyse des voies métaboliques a montré que, sur 35 cibles médicamenteuses, 14 enzymes participaient à des voies clés liées à la survie, à la prolifération et à la pathogenèse des agents pathogènes sans aucun mécanisme alternatif pour synthétiser le produit. L'analyse du microbiote intestinal a été réalisée pour identifier les cibles médicamenteuses qui n'affectent pas le microbiote chez l'homme. Une recherche de domaine a été effectuée pour les 14 cibles médicamenteuses identifiées à l'aide des bases de données Pfam et SMART et une analyse du réseau protéique a été réalisée à l'aide de STRING et Cytoscape v3.2.0. Les cibles médicamenteuses et les candidats vaccins proposés dans la présente étude serviraient de base à la conception d'inhibiteurs puissants et de vaccins sous-unitaires par une approche in silico pour lutter contre l'athérosclérose causée par des agents pathogènes infectieux.