Parampreet Kaur, Mohit Verma, Pavan K Chaduvula, Swati Saxena, Nikita Baliyan, Alim Junaid, Ajay K Mahato, Nagendra Kumar Singh et Kishor Gaikwad*
Les protéines PPR comprennent plusieurs centaines de membres parmi les plantes terrestres et régissent un éventail fascinant de fonctions dans les génomes des organites qui vont de la participation à la stabilisation des transcrits des organites, à l'édition de l'ARN jusqu'à la restauration de la fertilité des lignées CMS. Malgré la disponibilité des séquences génomiques de plusieurs espèces de légumineuses, aucun catalogage complet des membres de la famille des gènes PPR n'a été réalisé. Dans l'étude actuelle, nous avons identifié 523, 830, 534, 816, 441 et 677 protéines PPR dans les génomes de Cajanus, Glycine, Phaseolus, Medicago, Vigna et Cicer, respectivement, et leur catégorisation in silico complète a été entreprise pour les classer en diverses sous-classes et prédire leur localisation. Les coordonnées chromosomiques de 271 gènes PPR de Cajanus ont été prédites et leurs homologues ont été identifiés dans 5 autres légumineuses, révélant une conservation étendue du génome. Les gènes PPR des 6 espèces de légumineuses ont été sondés plus en détail pour identifier les PPR de type restaurateur de fertilité (RFL) sur la base du regroupement des protéines, suivi de recherches d'homologie avec les gènes Rf-PPR déjà connus. Soixante-dix gènes PPR RFL (sous-classe P) ont été identifiés et examinés par analyse phylogénétique qui a révélé une similitude étendue et des caractéristiques communes partagées par ces RFL dans toutes les espèces. Certains de ces PPR RFL étaient présents sous forme de petits groupes dans les génomes de Glycine, Phaseolus, Vigna et Cicer. Cette étude a généré une base de connaissances sur la famille de gènes PPR chez les légumineuses et ouvre plusieurs pistes pour de futures recherches sur leurs fonctions moléculaires, leurs relations évolutives et leur potentiel dans l'identification de marqueurs permettant le clonage des gènes Rf.