Journal of Data Mining en génomique et protéomique

Abstrait

Interaction des protéines et des voies dans le tissu cérébral humain atteint de la maladie d'Alzheimer à l'aide de la spectrométrie de masse

Malathi Narayan, Lisa Kirouac, Dale Chaput, Stanley Stevens, Jaya Padmanabhan et Umesh K Jinwal

La maladie d'Alzheimer (MA) est la forme la plus courante de démence et la 6e cause de décès aux États-Unis. Les principales caractéristiques pathologiques observées dans la MA comprennent la formation d'enchevêtrements neurofibrillaires intracellulaires composés de formes phosphorylées de la protéine tau associée aux microtubules et le dépôt de plaques extracellulaires composées de bêta-amyloïde. Cdc37 est un co-chaperon de Hsp90, qui recrute des kinases clientes dans le complexe Hsp90 pour le repliement et la stabilisation. Il a été précédemment démontré que Cdc37 peut non seulement se lier et préserver la tau, mais également stabiliser les kinases qui peuvent phosphoryler la tau. L'objectif de l'étude actuelle était d'identifier de nouvelles protéines interagissant avec Cdc37 dans les tissus MA humains par rapport aux tissus normaux en utilisant une approche basée sur l'immunoprécipitation combinée à la spectrométrie de masse. Nous avons identifié 39 protéines uniques qui interagissaient avec Cdc37 dans les échantillons de MA uniquement et 7 protéines qui interagissaient avec Cdc37 dans les échantillons normaux uniquement. 39 protéines se sont avérées se lier à Cdc37 dans les tissus MA et normaux. Parmi celles-ci, 18 ont montré une interaction accrue dans les tissus MA, 10 ont montré une interaction accrue dans les tissus normaux et 11 ont montré une interaction égale dans les deux échantillons. L'analyse des données indique que ces protéines interagissant avec Cdc37 pourraient signaler via les voies p70S6K, PI3K / Akt, TGFß, ErbB, NF-kB, calmoduline, p38 MAPK et JNK. L'identification de ces nouvelles protéines et voies liées à Cdc37 peut indiquer son rôle à la fois comme co-chaperon non kinase et dans d'autres voies dans le cerveau MA.