Journal of Data Mining en génomique et protéomique

Abstrait

Analyse lipidomique des troubles peroxysomaux : découverte de déficits des taux de phosphatidyglycérol dans la chondrodysplasie rhizomélique de type 1

Paul L. Wood et Nancy E. Braverman

Objectifs : Des diminutions des taux de plasmalogènes ont été systématiquement démontrées dans la chondrodysplasie rhizomélique de type 1 (RCDP1), un trouble génétique de la fonction peroxysomale. Cependant, une analyse lipidomique approfondie n'a pas été entreprise. Nous avons entrepris une telle analyse. Conception de l'étude : Nous avons effectué des analyses lipidomiques shotgun par spectrométrie de masse à haute résolution du plasma et des lymphoblastes de patients atteints de RCDP1. Résultats : Nous rapportons pour la première fois des diminutions des taux de phosphatidylglycérol dans le plasma et les lymphoblastes de patients atteints de RCDP1. Les taux de phosphatidylinositol et de phosphatidylsérine n'ont pas non plus été modifiés dans le plasma et les lymphoblastes. Ces données suggèrent que les diminutions de phosphatidylglycérol étaient dues à un catabolisme accru, peut-être à des tentatives cellulaires infructueuses de restaurer des taux de plasmalogènes déficients. Cette conclusion a été renforcée par la supplémentation des lymphoblastes RCDP1 avec des précurseurs plasmalogènes lipidiques éther qui contournent les peroxysomes dysfonctionnels. Ces précurseurs ont augmenté les niveaux cellulaires de plasmalogènes dans les lymphoblastes témoins et RCDP1, mais n'ont augmenté que les phosphatidylglycérols dans les lymphoblastes RCDP1. Conclusions : Dans l'ensemble, nos résultats indiquent que le trouble peroxysomal, RCDP1, qui est caractérisé par des déficits plasmalogènes, présente également des diminutions des taux de phosphatidylglycérols, compromettant ainsi également la fonction mitochondriale et la synthèse du surfactant pulmonaire. Étant donné le rôle des phosphatidylglycérols dans le surfactant, ces nouvelles données expliquent potentiellement le grave trouble respiratoire chez les enfants RCDP et peuvent ajouter un nouveau paramètre de dysfonctionnement mitochondrial chez ces patients.