Biochimie & Biochimie Analytique

Abstrait

Analyse du génome mitochondrial et évaluation du temps de phylogénie et de divergence de Strix aluco

David Smith1, Renna Roy2*

Dans cette étude, un génome mitochondrial complet de Strix aluco a été décrit pour la première fois, avec une longueur totale de 18 632 pb. Il y avait 37 gènes, dont 22 ARNt, 2 ARNr, 13 gènes codant pour des protéines (PCG) et 2 régions de contrôle non codantes (boucle D). Le séquençage de deuxième génération du génome mitochondrial complet de S. aluco a été réalisé à l'aide de la plateforme Illumina, puis Tytoninae a été utilisé comme groupe externe, le logiciel PhyloSuite a été appliqué pour construire l'arbre ML et l'arbre BI des Strigiformes , et enfin, l'arbre temporel de divergence a été construit à l'aide du logiciel Beast 2.6.7, l'âge des sédiments fossiles de Miosurniadiurna (6,0~9,5 mA) a été défini comme point de correction interne. L'ancêtre commun du Strix a divergé au cours du Pléistocène (2,58~0,01 mA). Le soulèvement spectaculaire des monts Qinling au Pléistocène moyen et l'oscillation climatique du Pléistocène ont provoqué ensemble la divergence du Strix entre les parties nord et sud de la Chine continentale. L'isolement de la rotation glaciaire-interglaciaire et le refuge glaciaire ont été la principale raison de la divergence de l'ancêtre commun du Strix uralensis et du S. aluco au cours de cette période. Cette étude fournit une référence pour l'histoire de l'évolution du Strix .