Journal of Data Mining en génomique et protéomique

Abstrait

Prédiction de la structure 3D de la toxine insecticide paralysante (ITX-1) de Tegenaria agrestis (araignée hobo)

AGIngale et NJChikhale

La toxine insecticide paralysante (ITX-1) (Tegenaria agrestis) implique de multiples composants antigéniques pour diriger et habiliter le système immunitaire à protéger l'hôte contre l'infection. Les toxines peptidiques d'araignée avec des affinités nanomolaires pour leurs récepteurs sont des outils pharmacologiques prometteurs pour comprendre le rôle physiologique des canaux ioniques et comme pistes pour le développement de nouveaux agents thérapeutiques et de stratégies pour les maladies liées aux canaux ioniques. Un modèle tridimensionnel (3D) a été développé pour la toxine insecticide paralysante (ITX-1) de Tegenaria agrestis (araignée hobo). Une méthode de modélisation d'homologie a été utilisée pour la prédiction de la structure. Pour la modélisation, une protéine modèle a été obtenue par mGenTHERADER, à savoir la structure de cristallographie aux rayons X à haute résolution d'une FERREDOXINE (1FCA) de Clostridium acidurici. En comparant la protéine modèle, un modèle approximatif a été construit pour la protéine cible en utilisant MODELLER, un programme de modélisation comparative. Le modèle a été validé à l'aide d'outils de vérification de la structure des protéines tels que PROCHECK et WHAT IF pour en vérifier la fiabilité. Les informations ainsi discutées apportent un éclairage sur la compréhension moléculaire de la toxine insecticide paralysante (Tegenaria agrestis). Le modèle 3D prédit peut être utilisé ultérieurement pour caractériser la protéine en laboratoire humide.