Journal of Modern Chemistry & Applications suit un système d'examen par les pairs en double aveugle. Des chercheurs indépendants dans des domaines de recherche connexes évaluent l'originalité, la validité et la pertinence des manuscrits soumis pour aider les éditeurs à déterminer si le manuscrit doit être publié dans la revue. Le manuscrit soumis sera généralement examiné par deux experts ou plus qui seront invités à évaluer si le manuscrit est scientifiquement solide et cohérent, s'il est dupliqué avec des travaux publiés et si le manuscrit est suffisamment clair pour être publié.
Chaque manuscrit soumis est géré pour un contrôle de qualité préliminaire par le bureau éditorial, suivi d'un processus d'examen externe par des pairs. Habituellement, le contrôle de qualité préliminaire se termine dans les 7 jours et reste principalement en référence au formatage de la revue, à l'anglais et à la portée de la revue.